本校校徽係民國45年8月改制為省立成功大學後所設計，其概念為「本校校址座落於文化古都台南市，台南市以鳳凰樹聞名，校徽上鳳凰花之設計，乃淵源於此。校徽中央的編鐘代表師鐸，代表成大人薪火相傳與尊師重道的精神與美德。」至民國100年1月5日99學年度第2次校務會議修正通過現有校徽，在編鐘內「成功」兩字下方加上本校創校西元年1931，並將校徽外環下排之梅花改為英文校名。